Lena-Lisa Wüstendörfer wurde 1983 in Zürich geboren. Sie studierte an der Musikhochschule der Stadt Basel Violine bei Adelina Oprean und Dirigieren bei Raphael Immoos, wo sie 2007 mit dem Master of Arts abschloss. 2007/08 war sie musikalische Assistentin von Claudio Abbado. Sie arbeitete bereits mit zahlreichen Orchestern und Chören zusammen, so etwa mit dem Frankfurter Opern- und Museumsorchester, dem Orchestra Mozart Bologna, der basel sinfonietta sowie dem Barockorchester La Visione und konzertierte mit der Nordböhmischen Philharmonie Teplice sowie dem Philharmonischen Orchester Ruse. Zudem ist sie künstlerische Leiterin des Messias-Chors Zürich-Oerlikon sowie des des Jungen Orchester Basel. Meisterkurse besuchte sie bei Johannes Schlaefli, Ralf Weikert sowie Georg Grün und erhielt weitere wichtige Impulse von Sylvia Caduff.
Seit 2003 wird sie durch das Förderprogramm der Schweizerischen Studienstiftung unterstützt und war von 2008-2010 Stipendiatin der Akademie Musiktheater heute der Deutschen Bank Stiftung. Neben ihrer künstlerischen Tätigkeit promoviert sie zurzeit am Musikwissenschaftlichen Institut der Universität Basel, wo sie auch ein Forschungsprojekt zur aktuellen Mahler-Interpretation leitet.